El microbioma es el conjunto de microorganismos, bacterias y hongos que están presentes en el suelo. Hablar de microbioma es hablar de salud del suelo.

A diferencia de otros seres vivos, las plantas necesitan adaptarse al entorno cambiante sin poder moverse y los microorganismos presentes el suelo además de proveerle alimento, también aportan compuestos que le ayudan a sobrevivir cambios de temperatura, cambios de humedad, precipitaciones o la actividad agrícola.

En la actualidad se está empezando a descubrir cómo esos microorganismos juegan roles importantes en la organoléptica lo que estamos cosechando. Los fertilizantes aplicados en el suelo alimentan a millones de microorganismos y por tanto colaboran a tener mejores cultivos.